Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
THRAP3Q9Y2W1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THRAP3Q9Y2W1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms