Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV86

Katna1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katna1Q9WV86 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Katna1Q9WV86 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Katna1Q9WV86 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Katna1Q9WV86 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Katna1Q9WV86 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Katna1Q9WV86 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Katna1Q9WV86 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Katna1Q9WV86 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Katna1Q9WV86 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Katna1Q9WV86 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Katna1Q9WV86 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Katna1Q9WV86 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Katna1Q9WV86 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Katna1Q9WV86 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Katna1Q9WV86 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Katna1Q9WV86 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Katna1Q9WV86 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Katna1Q9WV86 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Katna1Q9WV86 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Katna1Q9WV86 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Katna1Q9WV86 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Katna1Q9WV86 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms