Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx1Q9WV80 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms