Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU12

Snurf, SNRPN upstream reading frame protein, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnurfQ9WU12 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SnurfQ9WU12 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms