Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Nphp1Q9QY53 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nphp1Q9QY53 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nphp1Q9QY53 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nphp1Q9QY53 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nphp1Q9QY53 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nphp1Q9QY53 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nphp1Q9QY53 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nphp1Q9QY53 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nphp1Q9QY53 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nphp1Q9QY53 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nphp1Q9QY53 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nphp1Q9QY53 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Nphp1Q9QY53 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nphp1Q9QY53 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nphp1Q9QY53 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nphp1Q9QY53 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nphp1Q9QY53 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nphp1Q9QY53 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nphp1Q9QY53 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nphp1Q9QY53 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nphp1Q9QY53 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nphp1Q9QY53 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nphp1Q9QY53 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nphp1Q9QY53 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nphp1Q9QY53 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Nphp1Q9QY53 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nphp1Q9QY53 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Nphp1Q9QY53 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nphp1Q9QY53 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nphp1Q9QY53 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nphp1Q9QY53 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nphp1Q9QY53 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nphp1Q9QY53 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nphp1Q9QY53 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nphp1Q9QY53 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms