Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT0

Cnpy2, Protein canopy homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy2Q9QXT0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cnpy2Q9QXT0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cnpy2Q9QXT0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms