Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chaf1aQ9QWF0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms