Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PdcQ9QW08 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdcQ9QW08 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms