Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sfmbt1Q9JMD1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfmbt1Q9JMD1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms