Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Nectin3Q9JLB9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Nectin3Q9JLB9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Nectin3Q9JLB9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Nectin3Q9JLB9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Nectin3Q9JLB9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Nectin3Q9JLB9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nectin3Q9JLB9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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