Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap3m1Q9JKC8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ap3m1Q9JKC8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms