Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pard6bQ9JK83 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pard6bQ9JK83 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms