Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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