Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lmbr1Q9JIT0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmbr1Q9JIT0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms