Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Kcnmb4Q9JIN6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Kcnmb4Q9JIN6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Kcnmb4Q9JIN6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Kcnmb4Q9JIN6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Kcnmb4Q9JIN6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Kcnmb4Q9JIN6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Kcnmb4Q9JIN6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Kcnmb4Q9JIN6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Kcnmb4Q9JIN6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Kcnmb4Q9JIN6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnmb4Q9JIN6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnmb4Q9JIN6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Kcnmb4Q9JIN6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Kcnmb4Q9JIN6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Kcnmb4Q9JIN6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Kcnmb4Q9JIN6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Kcnmb4Q9JIN6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Kcnmb4Q9JIN6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnmb4Q9JIN6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnmb4Q9JIN6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Kcnmb4Q9JIN6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms