Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slco1c1Q9ERB5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slco1c1Q9ERB5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms