Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smco2Q9DA21 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smco2Q9DA21 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms