Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx5Q9D8U8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Snx5Q9D8U8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Snx5Q9D8U8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Snx5Q9D8U8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snx5Q9D8U8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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