Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cyp2c55Q9D816 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyp2c55Q9D816 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms