Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Capn9Q9D805 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Capn9Q9D805 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms