Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PudpQ9D5U5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PudpQ9D5U5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms