Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Zcchc13Q9D548 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Zcchc13Q9D548 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Zcchc13Q9D548 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Zcchc13Q9D548 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Zcchc13Q9D548 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Zcchc13Q9D548 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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