Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Fam90a1bQ9D4F3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam90a1bQ9D4F3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms