Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SarnpQ9D1J3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms