Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tspan11Q9D1D1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tspan11Q9D1D1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms