Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ91

Srfbp1, Serum response factor-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srfbp1Q9CZ91 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Srfbp1Q9CZ91 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms