Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snf8Q9CZ28 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snf8Q9CZ28 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms