Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx10Q9CWT3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx10Q9CWT3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx10Q9CWT3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx10Q9CWT3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx10Q9CWT3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx10Q9CWT3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx10Q9CWT3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx10Q9CWT3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx10Q9CWT3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx10Q9CWT3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx10Q9CWT3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Snx10Q9CWT3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms