Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx2Q9CWK8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx2Q9CWK8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms