Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH6

Psma8, Proteasome subunit alpha type-7-like, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma8Q9CWH6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psma8Q9CWH6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms