Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CRC3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q9CRC3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CRC3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CRC3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CRC3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CRC3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CRC3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CRC3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q9CRC3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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