Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc43Q9CR29 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc43Q9CR29 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms