Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX5

Cldnd1, Claudin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd1Q9CQX5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldnd1Q9CQX5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms