Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PompQ9CQT5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
PompQ9CQT5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PompQ9CQT5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PompQ9CQT5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PompQ9CQT5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PompQ9CQT5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PompQ9CQT5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PompQ9CQT5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PompQ9CQT5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PompQ9CQT5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PompQ9CQT5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PompQ9CQT5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PompQ9CQT5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PompQ9CQT5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PompQ9CQT5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PompQ9CQT5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms