Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS6

Gkn2, Gastrokine-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn2Q9CQS6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gkn2Q9CQS6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gkn2Q9CQS6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms