Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atp5f1Q9CQQ7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Atp5f1Q9CQQ7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Atp5f1Q9CQQ7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp5f1Q9CQQ7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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