Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms