Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms