Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ39

Med21, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med21Q9CQ39 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med21Q9CQ39 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms