Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Chmp3Q9CQ10 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Chmp3Q9CQ10 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms