Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Nsmce3Q9CPR8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Nsmce3Q9CPR8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Nsmce3Q9CPR8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Nsmce3Q9CPR8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Nsmce3Q9CPR8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Nsmce3Q9CPR8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Nsmce3Q9CPR8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Nsmce3Q9CPR8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Nsmce3Q9CPR8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Nsmce3Q9CPR8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nsmce3Q9CPR8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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