Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prpf8Q99PV0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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