Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt23Q99PS0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt23Q99PS0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt23Q99PS0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt23Q99PS0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt23Q99PS0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt23Q99PS0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt23Q99PS0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt23Q99PS0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt23Q99PS0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt23Q99PS0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt23Q99PS0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt23Q99PS0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt23Q99PS0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt23Q99PS0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt23Q99PS0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt23Q99PS0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt23Q99PS0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt23Q99PS0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt23Q99PS0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt23Q99PS0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt23Q99PS0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt23Q99PS0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt23Q99PS0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt23Q99PS0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt23Q99PS0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt23Q99PS0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt23Q99PS0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms