Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mrpl3Q99N95 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mrpl3Q99N95 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms