Protein–RNA interactions for Protein: Q99MQ3

Pink1, Serine/threonine-protein kinase PINK1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pink1Q99MQ3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pink1Q99MQ3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pink1Q99MQ3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms