Protein–RNA interactions for Protein: Q99M54

Cdca3, Cell division cycle-associated protein 3, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca3Q99M54 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca3Q99M54 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca3Q99M54 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca3Q99M54 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca3Q99M54 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca3Q99M54 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca3Q99M54 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca3Q99M54 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca3Q99M54 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca3Q99M54 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca3Q99M54 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca3Q99M54 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca3Q99M54 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca3Q99M54 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca3Q99M54 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca3Q99M54 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca3Q99M54 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca3Q99M54 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca3Q99M54 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca3Q99M54 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca3Q99M54 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca3Q99M54 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca3Q99M54 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca3Q99M54 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca3Q99M54 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca3Q99M54 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cdca3Q99M54 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cdca3Q99M54 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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