Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lactb2Q99KR3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lactb2Q99KR3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms