Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubxn2aQ99KJ0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn2aQ99KJ0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms