Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nlgn1Q99K10 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nlgn1Q99K10 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nlgn1Q99K10 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nlgn1Q99K10 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nlgn1Q99K10 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Nlgn1Q99K10 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nlgn1Q99K10 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlgn1Q99K10 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlgn1Q99K10 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlgn1Q99K10 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlgn1Q99K10 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlgn1Q99K10 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlgn1Q99K10 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlgn1Q99K10 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlgn1Q99K10 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlgn1Q99K10 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlgn1Q99K10 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlgn1Q99K10 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlgn1Q99K10 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlgn1Q99K10 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlgn1Q99K10 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlgn1Q99K10 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlgn1Q99K10 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlgn1Q99K10 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlgn1Q99K10 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlgn1Q99K10 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlgn1Q99K10 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nlgn1Q99K10 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nlgn1Q99K10 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nlgn1Q99K10 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nlgn1Q99K10 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nlgn1Q99K10 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlgn1Q99K10 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms