Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Smim11aQ99J19 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Smim11aQ99J19 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Smim11aQ99J19 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Smim11aQ99J19 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smim11aQ99J19 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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